新疆医科大学厚博学院创办于2003年， 是由新疆医科大学举办的一所按新机制、新模式运作，充分依托新疆医科大学综合办学优势，具有浓郁地域特色的全日制普通本科层次独立学院。目前，学院开设有临床医学、口腔医学、药学、医学影像技术、医学检验技术、护理学、公共事业管理、信息管理与信息系统等八个专业。
2012年，经教育部和自治区人民政府批准，新疆医科大学与克拉玛依市采取合作办学的方式共同建设厚博学院。厚博学院定位为医学类院校，学生规模近期为5000人，远期为10000人，未来发展方向为医学类和非医学类专业并存的综合性本科院校。2015年，厚博学院正式迁入克拉玛依市。克拉玛依校区位于克拉玛依市城南新区，规划总面积1140余亩，总建筑面积24万平方米。校园由美国NBBJ公司规划设计，学院建设完成后，硬件条件、基础设施将达到国内一流水平。
遵循“厚德、博学、笃志、力行”校训，以培养实用型、复合型、高素质人才为目标，以人才市场需求为导向，以优质师资力量为基础，以现代管理制度为保障，以过硬教学质量求发展，厚博学院将根据医学科学发展最新趋势，以优质教育资源全方位培养符合社会发展需要和人才市场需求的医学各类人才。
新疆医科大学厚博学院为2003年5月6日获准成立，并根据2004年2月5日教育部教发函[2004]13 号文件正式批准，由新疆医科大学举办的一所按新机制、新模式运作，充分依托、发挥新疆医科大学综合办学优势，中西医并重，具有浓郁地域特色的本、专科层次的综合性高等医学院校。厚博学院现有教学管理科、学生管理科、财务管理办公室、综合办公室等4个职能科室，8名工作人员。
新疆医科大学厚博学院现有鲤鱼山和克拉玛依两个校区，是国家教育部确认的独立学院。
新疆医科大学鲤鱼山校区占地300多亩，1期工程共投资1.5个亿，现建有1栋教学楼、1栋学生食堂，2栋学生公寓，总建筑面积达到8万多平方米。其中，形态学实验室、机能学实验室、计算机实验室、语音室、浴室、图书室、学生活动中心已陆续建成并投入使用，学习、生活设施日趋完善。2015年克拉玛依校区投入使用。克拉玛依校区占地2355亩。
申请举办厚博学院的新疆医科大学，是一所集教学、科研、医疗为一体的综合性医科大学，目前有18所学院、4个系。拥有临床医学、药学、公共卫生与预防医学等3个博士后流动站；内科学、劳动卫生与环境卫生学、药理学等3个博士学位授权点；37名博士生导师。另外，新疆医科大学拥有35个二级学科硕士学位授权点，315名硕士生导师。
新疆医科大学拥有5个省级重点学科，即，生物化学与分子生物学，药理学、内科学、外科学，劳动卫生与环境卫生学；包虫病实验室、新疆地方病分子生物学实验室等2个省级重点实验室。
