新疆大学科学技术学院成立于2002年8月。2004年1月，通过教育部关于办学资质的审核，成为我国首批本科院校举办的独立学院。2012年5月,通过自治区学位委员会、自治区教育厅审核,学院取得学士学位授予权资格。6月，自治区人民政府决定新疆大学与阿克苏地区合作办学,由阿克苏地区负责完成校园基本建设，校园建成后，将新疆大学科学技术学院搬迁至阿克苏办学，由新疆大学负责教学和管理。条件成熟、申请教育部评估合格后转制为公办二本院校。
新疆大学科学技术学院现校址为新疆乌鲁木齐市西北路499号，搬迁后为阿克苏地区温宿县新城区学府路1号。阿克苏校区校园占地面积2856亩，分三期建设，其中一期占地面积1700亩，建筑面积近30万平方米，共投入建设资金15亿元，规划在校生6000-8000人；二期规划建筑面积21.7万平方米，远期规划建筑面积17万平方米；远期规划在校生15000人。
新疆大学科学技术学院交通便利、环境幽雅、人文荟萃。学院拥有专兼任教师257名（专任教师均为硕士及以上学历）其中教授23人，副教授79人，具有博士学位教师72人，硕士学位教师182人。现有18个本科专业，覆盖工学、文学、经济学、管理学、法学等五大学科门类。在校本科5500余人，是一所面向全国统一招生的综合性全日制应用型本科大学。
新疆大学科学技术学院地处“塞外江南”、“中国红富士苹果之乡”的阿克苏，交通便利，环境幽雅，人文荟萃。学院校园环境优美，教学和生活设施齐全。学院大力加强校园内涵建设，投入3000余万元建设智慧化校园；近1600万元配置新的教学和实验实训设备仪器；1043万元配置图书及信息资料，教学方面有现代化教学电脑机房、语音室、多媒体教室、先进实验室、实训基地等设施；大学生活方面有图书馆、礼堂、交流中心、风雨操场、体育馆、食堂、学生连体宿舍公寓、教职工公寓等设施。新疆大学科学技术学院搬迁后校址位于阿克苏地区温宿县新城区学府路1号，校园占地面积2856亩，规划建筑面积68.7万平方米，分三期建设，其中一期占地面积1700亩，建筑面积近30万平方米，共投入建设资金15亿元，规划在校生6000-8000人（一期工程由清华大学建筑设计研究院规划设计，其中图书馆、体育馆、学术交流中心等建筑风格别具一格），二期规划建筑面积21.7万平方米，远期规划建筑面积17万平方米，远期规划在校生15000人。学院是以工学、经济学为主，管理学、文学、法学等各学科协调发展的综合应用型现代化本科院校，面向全国招生。
三高标准：高起点、高标准、高质量。阿克苏地委、行署提出校园基本建设和教学基础能力建设创全国“一流规划设计，一流质量标准，一流建设速度”，教学内涵建设按照创全疆“一流办学理念，一流师资队伍，一流教学质量”的要求。
资源雄厚：根据中央新疆工作会议精神，教育强省浙江对口援建。新疆大学科学技术学院与浙江工业大学、杭州电子科技大学、浙江财经大学、浙江工商大学等四所大学建立对口援建关系，部分专业课程由浙江高校教师授课，采取浙江每所高校包建4-5个专业的形式，打造一批知名品牌专业。教学管理由新疆大学负责，部分专业由新疆大学选派教师授课。
公办本科：新疆大学科学技术学院阿克苏校区是新疆大学科学技术学院与阿克苏地区合作建设的院校，由阿克苏行政公署全额投资完成校园基本建设，根据合作协议，阿克苏校区办学条件成熟后，申请教育部评估合格后转制为公办二本院校。
新疆大学科学技术学院坚持从严治教，狠抓学风建设，致力于培养应用型、技能型高素质人才。在稳步提升教学质量的同时，加强社会实践，开展丰富多彩、健康向上的校园科技文化活动，活动内容涵盖学术报告类、经验交流类、知识竞赛类、文艺演出类、体育竞赛类、文化宣传类、语言竞技类等20余项，并鼓励学生广泛参加各类学科竞赛，全面提高大学生的综合素质。近年来，学院学生在大学生英语竞赛、大学生基础力学实验竞赛、大学生会计信息化技能大赛、大学生数学建模大赛等各类全国大赛中获奖，其中获国家级奖项64个、省部级奖项93个
