南京医科大学是江苏省属重点高校。学校创建于1934年，时名江苏省立医政学院，是国内最早开展研究生教育的高等学府之一。1957年，更名为南京医学院。1962年，被列为全国首批六年制医药院校。1981年，被批准为全国首批博士、硕士学位授予单位。1993年，更名为南京医科大学。
学校现有硕士学位授权点55个，博士学位授权点35个，博士后科研流动站3个，学位授权点已覆盖医学、理学、工学、管理学、法学、教育学和文学等7个学科门类，拥有3个国家重点学科、1个国家重点培育学科、4个江苏省一级学科重点学科、12个省级重点学科。
目前，学校设有基础医学院、公共卫生学院、第一临床医学院、第二临床医学院、第三临床医学院、第四临床医学院、鼓楼临床医学院、无锡临床医学院、青岛临床医学院、口腔医学院、药学院、护理学院、医政学院、外国语学院、国际教育学院、继续教育学院和高等职业技术学院等16个学院和１个独立学院??康达学院。在南京、苏州、无锡、常州、淮安、上海、杭州等地拥有20所附属医院和40多所教学医院。
学校设有12个本科专业、2个六年制双学位专业和３个七年制专业(方向)。目前，在校生总数达1.3万多人，已形成从本科生到硕士生、博士生及博士后，从全日制到成人教育、留学生教育全方位、多层次的办学格局和教育体系。
学校现有在职教职工1500多人。有在职专任教师649人，有教授116人、副教授175人，有博士生导师185人、硕士生导师812人（含附属医院等）。学校拥有一批优秀的中青年骨干教师入选各类人才支持计划，有多人被评为国家教学名师或各级优秀教师，有“国家级教学团队”1个，教育部“创新团队”1个。学校是国家卫生部认可的全国进修基地和教育部批准接受留学生学习的高校之一，与南京大学、东南大学、南京农业大学一起成为江苏省高层次人才培养计划??“333工程”培训基地。2006年和2008年，学校两度被评为“江苏省师资队伍建设先进高校”。
