南京航空航天大学设有飞行器设计与工程，飞行器环境与生命保障工程，建筑环境与能源应用工程，飞行器动力工程，探测制导与控制技术，微电子科学与工程等专业。
南京航空航天大学专业名单
| 学院 | 专业名称 | 可以培养层次 | ||||
| 学士 | 硕士 | 博士 | 博士后 | |||
| 航空学院 | 飞行器设计与工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 飞行器环境与生命保障工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 建筑环境与能源应用工程 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 工程力学 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 能源与动力学院 | 飞行器动力工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 能源与动力工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 车辆工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 自动化学院 | 自动化 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 电气工程及其自动化 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 测控技术与仪器 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 生物医学工程 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 探测制导与控制技术 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 电子信息工程学院 | 电子信息类 | 电子信息科学与技术 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ |
| 电子信息科学与技术（微波毫米波系统与器件技术） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 信息工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 微电子科学与工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 机电学院 | 机械工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 工业设计 | ☆ | ☆ | ||||
| 飞行器制造工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 飞行器制造工程（航空维修工程与技术） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 材料科学与技术学院 | 材料科学与工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 应用化学 | ☆ | ☆ | ||||
| 核工程类 | 核工程与核技术 | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 辐射防护与核安全 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 新能源材料与器件 | ☆ | ☆ | ||||
| 民航/飞行学院 | 交通运输（空中交通管制与签派） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 交通运输（民航运输管理） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 交通运输（民航机务工程） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 交通运输（民航电子电气工程） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 交通运输（机场运行与管理） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 土木工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 飞行器适航技术 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 飞行技术 | ☆ | |||||
| 理学院 | 信息与计算科学 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 应用物理学 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 应用统计学 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 经济与管理学院 | 管理科学与工程类 | 信息管理与信息系统 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ |
| 工业工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 经济与贸易类 | 国际经济与贸易 | ☆ | ☆ | |||
| 金融学 | ☆ | ☆ | ||||
| 工商管理类 | 工商管理 | ☆ | ☆ | |||
| 会计学 | ☆ | ☆ | ||||
| 人文与社会科学学院 | 法学 | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 政治学与行政学 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 公共事业管理 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 艺术学院 | 广播电视学 | ☆ | ☆ | |||
| 音乐表演 | ☆ | ☆ | ||||
| 戏剧影视美术设计 | ☆ | ☆ | ||||
| 环境设计 | ☆ | ☆ | ||||
| 外国语学院 | 英语（民航业务、国际贸易） | ☆ | ☆ | |||
| 日语 | ☆ | ☆ | ||||
| 航天学院 | 飞行器控制与信息工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 航空航天工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 光电信息科学与工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 计算机科学与技术学院 | 计算机科学与技术 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 信息安全 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 软件工程 | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
| 物联网工程 | ☆ | ☆ | ☆ | |||
| 长空学院 | 航空航天类（飞行器设计与工程、飞行器环境与生命保障工程、飞行器动力工程、飞行器制造工程、飞行器制造工程（航空维修工程与技术）） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 国际教育学院 | 自动化（航空电子与控制）（中外合作办学） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | |
| 交通运输（机场运行与管理）（中外合作办学） | ☆ | ☆ | ☆ | ☆ | ||
