在平行志愿投档时，确定考生投档顺序的主要依据是考生的位次。
位次即考生在全省其所属于科类（文史/理工等）考生中的成绩位置顺序。分高的考生位次在前，分低的考生位次在后。在同分的情况下，不同科类的考生位次确定方式有所不同。
例如，普通类文史类考生依次比对语文、文科综合、数学、外语成绩来确定位次；理工类考生依次比对数学、理科综合、语文、外语成绩来确定位次。每一名考生的位次是唯一的。
投档时，计算机先将所有批次线上的未录取考生，按成绩从高分到低分排序，使每个考生都确定位置；再由计算机将排好序的考生按其所填的各学校依次进行检索。先投分数较高、排序在前的考生，再投排序在后的考生。
对单个考生而言，计算机检索到该考生时，根据考生填报的学校志愿顺序依次投档。这个过程是一次性完成的。
例如，理工类考生 A 位次为 8000 位，将某大学填报在平行志愿 A 院校，考生 B 位次为 7999 位，将同一所大学填报在平行志愿 I 院校。由于考生 B 位次靠前，在投档时会优先检索考生 B 的志愿，如果该大学只剩一个名额没满，考生 B 前 8 个院校未投入的话，也会优先被该大学提档。
需要注意的是，虽然平行志愿中的各志愿均为第一志愿，但自然顺序有先后之分，考生在填报平行志愿时，最好将最想就读的学校填在靠前的位置。同时，应认真了解相关的投档录取规则，结合自己的成绩、专业及院校偏好等因素，合理安排志愿顺序，并仔细查阅高校的招生章程，关注专业的特殊要求等，以增加投档和录取的机会。
