黑龙江工程学院开设的专业有土木工程、测绘工程、交通运输、车辆工程、工程管理、机械设计制造及其自动化、会计学、车辆工程和机械设计制造及其自动化、计算机科学与技术等，具体完整专业名单请看下表。
黑龙江工程学院专业一览表
| 序号 | 二级学院 | 专业设置 |
| 1 | 土木与建筑工程学院 | 道路桥梁与渡河工程、土木工程、工程造价、工程管理、建筑学、城乡规划、给排水科学与工程、建筑环境与能源应用工程 |
| 2 | 测绘工程学院 | 测绘工程、遥感科学与技术、地理信息科学 |
| 3 | 汽车与交通工程学院 | 车辆工程、汽车服务工程、交通运输、交通工程、轨道交通信号与控制、物流工程 |
| 4 | 机电工程学院 | 机械设计制造及其自动化、材料成型及控制工程、机械电子工程、机械工程、能源工程及自动化 |
| 5 | 材料与化学工程学院 | 应用化学、材料科学与工程、材料化学、功能材料、复合材料与工程 |
| 6 | 电气与信息工程学院 | 电气工程及其自动化、自动化、电子科学与技术、电子信息工程、测控技术与仪器 |
| 7 | 计算机科学与技术学院 | 计算机科学与技术、信息管理与信息系统、物联网工程 |
| 8 | 经济管理学院 | 会计学、财务管理、市场营销、旅游管理、金融工程 |
| 9 | 艺术与设计系 | 环境设计、视觉传达设计、动画、数字媒体艺术、产品设计 |
| 10 | 数学系 | 信息与计算科学 |
| 11 | 外语系 | 英语、俄语 |
| 12 | 人文与社会科学系 | 社会工作、网络与新媒体 |
| 13 | 国际合作教育中心 | 与“英国格林威治大学”联办土木工程、车辆工程、机械设计制造及其自动化、会计学、电子信息工程、计算机科学技术专业 |
黑龙江工程学院特色重点专业名单
1、国家级特色专业：测绘工程。
2、省级重点专业：土木工程、测绘工程、交通运输、车辆工程、工程管理、机械设计制造及其自动化、会计学。
3、国家级卓越计划专业：土木工程、测绘工程、车辆工程和机械设计制造及其自动化、计算机科学与技术、电气工程及其自动化、材料科学与工程。
