事业单位的经费形式一般分为三种：一是财政拨款，即全额拨款，或称财政性资金基本保障；二是财政补助，即差额补贴，或称财政性资金定项或定额补助；三是自收自支，即经费自理，或称财政性资金零补助。其中：财政补助（即差额补贴）是指事业单位从同级财政部门取得的各类财政拨款，包括正常经费和专项资金。在我国传统的预算体制和行政事业单位预算会计制度下，该资金也称为经费，收到的该笔资金称为拨入经费。
按现行体制，我市对差额事业单位的补助为基本工资的60%部分，在职人员医疗保险的60%部分，离、退休人员离、退休费的100%部分（其中地方津贴“75元、人。月”财政承担50%），离、退休人员医保经费的100%部分（其中计算基数中地方津贴“75元、人。月”财政承担50%）。
剩余40%部分的基本工资、住房公积金、单位公用经费由事业单位从单位征收的行政事业性收费和非营利性（例如公立医院等）经营收入中补充。
差额事业单位的工资构成也是由岗位工资、薪级工资和事业单位绩效工资构成，其中：岗位工资和薪级工资由财政承担60%部分，剩余的基本工资40%部分和绩效工资由单位组织收入的行政事业性收费和经营收入承担。从工资总额来看，全额事业单位与差额事业单位工资总量是一致的。
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