学校高度重视科研工作，“十一五”期间，共承担厅局级以上科研课题74项，获厅局级以上科研奖励40余项；出版专著、教材72部，发表学术论文2000余篇；积极开展教学研究工作，获省级教学成果奖10项，其中一等奖2项；积极推进教学改革，口腔医学专业被评为省级教学改革试点专业，病理学、组织与胚胎学、儿科学3门课程被评为省级教学改革试点课程，组织与胚胎学、病理学、生物化学、药理学、病理生理学5门课程被评为省级精品课程。
学校坚持开放办学，注重加强对外交流与合作，与美国加州大学圣迭戈医学院、韩国延世大学医科大学、加图立大学校医科大学建立了友好校际关系，与美国杜克大学、佛罗里达海湾海岸大学、日本早稻田大学、英国皇家护理学院、新西兰奥塔古大学等国外高校建立了合作与学术交流关系。“国际彩虹医疗队”在学校设有中国学术交流中心。经山东省教育厅批准，2002年获得留学生教育资格，留学生教育开始起步。
进入新世纪，学校确立了“坚持以发展为主题，深化两项改革（教育教学改革、校内管理体制改革），推进三个创新（观念创新、体制创新、机制创新），实施四大战略（质量立校战略、人才强校战略、科研兴校战略、重点带动战略），强化五个保障（思想保障、组织保障、物质保障、文化保障、安全保障）”的办学工作思路，积极推进学校各项事业的全面协调可持续发展。
发展中的滨州医学院既充满了蓬勃向上的朝气与活力，又有着深厚的人文底蕴与文化积淀；既有严谨治学、躬身育人的一代名师，又有勤奋好学、奋发成才的莘莘学子。勤劳的滨医人正在为实现建设省内一流、国内知名医科大学的目标而努力奋斗，滨州医学院的明天一定会更加灿烂美好！
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