南方医科大学第四轮学科评估于2016年4月启动，按照“自愿申请、免费参评”原则，采用“客观评价与主观评价相结合”的方式进行。评估体系在前三轮的基础上进行诸多创新；评估数据以“公共数据和单位填报相结合”的方式获取；评估结果按“分档”方式呈现，具体方法是按“学科整体水平得分”的位次百分位，将前70%的学科分9档公布：前2%（或前2名）为A+，2%～5%为A（不含2%，下同），5%～10%为A-，10%～20%为B+，20%～30%为B，30%～40%为B-，40%～50%为C+，50%～60%为C，60%～70%为C-。
一、南方医科大学学科评估结果排名
| 序号 | 学校代码 | 学校名称 | 一级学科代码 | 一级学科名称 | 评选结果 |
| 1 | 12121 | 南方医科大学 | 1001 | 基础医学 | B+ |
| 2 | 12121 | 南方医科大学 | 1004 | 公共卫生与预防医学 | B+ |
| 3 | 12121 | 南方医科大学 | 1006 | 中西医结合 | B+ |
| 4 | 12121 | 南方医科大学 | 0831 | 生物医学工程 | B |
| 5 | 12121 | 南方医科大学 | 1002 | 临床医学 | B |
| 6 | 12121 | 南方医科大学 | 1007 | 药学 | B |
| 7 | 12121 | 南方医科大学 | 1011 | 护理学 | B |
| 8 | 12121 | 南方医科大学 | 1003 | 口腔医学 | C- |
| 9 | 12121 | 南方医科大学 | 1008 | 中药学 | C- |
二、南方医科大学师资力量介绍
学校现有国家级人才项目入选者239人次，省级人才项目入选者354人次，其中：两院院士3人、双聘院士6人，国家级教学团队3个，国家教学名师4人，国家海外高层次人才15人，21人，国家杰青19人，国家特支计划12人（青年拔尖人才3人），“百千万人才工程”国家级人选20人，科技部中青年科技创新领军人才6人，国家“优青”13人。
学校共有国家重点实验室、国家临床医学研究中心、粤港澳大湾区脑与类脑研究中心等国家和省部级科研平台93个，科技部重点领域创新团队2个、教育部创新团队2个、国家自然科学基金创新研究群体1个。共获国家科技三大奖18项，省部级一等奖55项，获国家科技奖数量位居广东省属高校第一。连续三个五年计划牵头承担传染病防治国家科技重大专项。2021年获国家自然基金309项，立项数居全国独立医科院校第2位，连续6年跻身全国30强。《南方医科大学学报》入选“中国科技期刊卓越行动计划”梯队期刊类项目，连续8年获得“百种中国杰出学术期刊”称号，综合评价得分位列全国医药大学学报类期刊第1位。
