沈阳药科大学招生专业有药学、药物制剂、药物分析、中药学、中药资源与开发、药学（食品药学）、中药制药、葡萄与葡萄酒工程、工商管理、市场营销、国际贸易与经济、药事管理等，具体更多完整招生专业请看下表。
沈阳药科大学招生专业一览表
| 学院 | 专业 |
| 药学院 | 药学、药物制剂、药物分析、国家理科基础药学基地班（八年制本硕博连读） 药学（日语强化班，五年制、药学（英语强化班，五年制） 药学（专升本） |
| 制药工程学院 | 制药工程、环境科学、应用化学、药物化学 |
| 中药学院 | 中药学、中药资源与开发、药学（食品药学）、中药制药、葡萄与葡萄酒工程 中药学（日语强化班，五年制） |
| 生命科学与生物技术制药学院 | 生物工程、临床药学（五年制）、生物技术制药 生命科学与技术基地班（六年制本硕连读；前两年半在吉林大学进行基础科目学习，第六学期回该校进行研究生课程学习） |
| 工商管理学院 | 工商管理、市场营销、国际贸易与经济、药事管理 市场营销（专升本） |
| 医疗器械学院 | 生物医学工程 |
沈阳药科大学重点特色专业名单
1、国家级一类特色专业：药学、制药工程、药物制剂专业、中药学、生物工程
2、辽宁省综合改革试点专业：药学、药物制剂
3、辽宁省级工程人才培养模式改革试点专业：制药工程
4、辽宁省级重点支持专业：中药学、生物工程
5、国家级重点学科：药剂学
6、国家中医药管理局中医药重点学科：中药分析学
7、辽宁省重点学科：药学、中药学
8、辽宁省特色学科建设工程“提升学科”：药物化学、药物分析学
9、辽宁省特色学科建设工程“特色学科”：中药学
