厦门医学，创建于1953年9月，由当时闽南唯一的公立护士学校-厦门护士职业学校、厦门医士学校和厦门第二医院护士学校合并而成，“文革”一度停办，1972年复办。办学近60年来，经过几代人艰苦奋斗、自强不息、求真务实、开拓创新，初步建成了一所规模适度、结构合理、特色鲜明的医学高等专科学校。建校以来，已培养二万多名合格的卫生技术人才，为厦门及海西的医疗、卫生、教育事业做出了积极贡献。2007年3月经国家教育部批准成立“厦门医学高等专科学校”。
学校的前身是鼓浪屿救世医院于1900年开办的附设医学专门学校。
1953年9月，与厦门护士职业学校、厦门医士学校和厦门第二医院护士学校合并而成，校名为“鼓浪屿医院卫生学校”。
最初的校址在厦禾路336号，迁至厦禾路350号，1956年迁石泉路7 号，1958创办厦门医学院，厦门卫校石泉山校舍划归医学院使用，厦门医学中等教育改由各医院举办。
1963年，“鼓浪屿医院卫生学校”迁到石泉路7号原厦门卫生学校旧址，恢复厦门卫生学校旧称。“文革”期间，学校遭受严重冲击，直至停办。
1972年秋季学校复办时，校名改称为“福建省厦门卫生学校”，校址就确定在了白鹿路24号，从此，这块土地就成为厦门培养中等卫生技术人才的摇篮。从学校创办至今，先后开设过护士、助产士、西医士、中医士、口腔医士、卫生财会与统计等专业，1979年招收过医学大专班。
1985年在华厦基金会的赞助下开始筹建口腔医院，作为学校的附属医院，90年医院正式建成。
在1990年以后，学校获得比较大的进步，上了两个台阶，第一个台阶是在90年到92年，这个时期学校抓好各项基础设施的建设，校容校貌更新，师生精神空前振奋起来，上第二个台阶是在93年至今，这个时期学校迅速发展，规模扩大，管理水平、教学质量普遍得到提高。这几十年来，学校毕业学生一万多名，他们遍布全省各地，为人民健康事业做出了应有的贡献，涌现出如全国卫生先进工作者林成水、全国模范护士陈珍霞等一大批优秀卫生技术人才。
2001年，经市政府批准在学校成立厦门医学高等专科学校筹建处，负责组建厦门医高专工作。
2001年10月厦门市政府办公厅批准成立“厦门医学职业技术学院筹建处”，并挂牌。
2002年厦门医高专通过省高校设置评审委员会考察，经省长常务会、省委常委会议决定，报教育部验收，医高专已于2003年秋季开始招生。厦门医学高等专科学校系厦门市政府举办，在厦门卫生卫生学校的基础上筹建。
2002年5月，“厦门医学职业技术学院”更名为“厦门医学高等专科学校”。
2007年元月29日，全国高等学校设置评议委员会第五届一次会议在哈尔滨市举行，经过委员会专家投票表决，厦门医学高等专科学校获得通过。
在2007年3月16日传来了又喜讯,根据中华人民共和国教育部教发函（2007）45号文件，同意在厦门卫生学校基础上建立厦门医学高等专科学校！
学校积极开展医学高等教育，积累了一定的高等医学教育教学和管理经验。学校1979?1983年曾办过临床医学大专班，从1998年起，学校先后与福建医科大学、福建中医学院、厦门大学医学院联办口腔医学、护理学、口腔工艺技术、临床医学、卫生信息管理等专科专业。几所高校对学校开展了全面的考察与评估，进行多门学科抽考，他们一致认为学校完全能够胜任医学高职教育。通过医学高职教育实践，使学校积累了开办大专层次医学教育的经验，初步掌握了医学专科及高职医学教育的规律，逐步探索出一条培养高等应用型卫生技术人才的路子。此外，学校还拥有以下许多较完善的临床教学基地。
