福建省共有28所在二本批次招生的大学参与了福建二本大学排名，其中排名第一的是厦门理工学院，排名第二的是福建江夏学院，排名第三的是闽江学院。
以下是福建二本大学排名2016具体榜单，根据理科二本录取平均分排名，包含部分专业在二本招生的一本大学。
福建二本大学排名
| 厦门二本大学排名 | 学校名称 | 录取线差 | 省市分数线 | 录取平均分 |
| 1 | 厦门理工学院 | 107 | 410(第二批) | 517 |
| 2 | 福建江夏学院 | 101 | 410(第二批) | 511 |
| 3 | 闽江学院 | 98 | 410(第二批) | 508 |
| 4 | 福建工程学院 | 97 | 410(第二批) | 507 |
| 5 | 福建警察学院 | 95 | 410(第二批) | 505 |
| 6 | 莆田学院 | 91 | 410(第二批) | 501 |
| 7 | 福建中医药大学 | 86 | 410(第二批) | 496 |
| 8 | 厦门大学嘉庚学院 | 83 | 410(第二批) | 493 |
| 9 | 集美大学诚毅学院 | 71 | 410(第二批) | 481 |
| 10 | 宁德师范学院 | 69 | 410(第二批) | 479 |
| 11 | 三明学院 | 67 | 410(第二批) | 477 |
| 12 | 龙岩学院 | 67 | 410(第二批) | 477 |
| 13 | 武夷学院 | 62 | 410(第二批) | 472 |
| 14 | 闽南师范大学 | 60 | 410(第二批) | 470 |
| 15 | 泉州师范学院 | 57 | 410(第二批) | 467 |
| 16 | 福州大学至诚学院 | 57 | 410(第二批) | 467 |
| 17 | 福建师范大学协和学院 | 48 | 410(第二批) | 458 |
| 18 | 仰恩大学 | 41 | 410(第二批) | 451 |
| 19 | 福建农林大学金山学院 | 35 | 410(第二批) | 445 |
| 20 | 厦门工学院 | 34 | 410(第二批) | 444 |
| 21 | 福建农林大学东方学院 | 30 | 410(第二批) | 440 |
| 22 | 阳光学院 | 24 | 410(第二批) | 434 |
| 23 | 福州理工学院 | 24 | 410(第二批) | 434 |
| 24 | 福建师范大学闽南科技学院 | 18 | 410(第二批) | 428 |
| 25 | 福州外语外贸学院 | 17 | 410(第二批) | 427 |
| 26 | 厦门华厦学院 | 14 | 410(第二批) | 424 |
| 27 | 闽南理工学院 | 14 | 410(第二批) | 424 |
| 28 | 泉州信息工程学院 | 12 | 410(第二批) | 422 |
厦门理工学院简介
厦门理工学院创立于1981年，位于中国东南海滨城市厦门，是福建省属公立本科大学，福建省重点建设高校。前身鹭江职业大学是福建省最早的全日制职业技术大学。2003年筹建升本并试招7个专业的本科生，2004年经教育部批准升本并更名为“厦门理工学院”。学校是教育部第二批“卓越工程师教育培养计划”高校100多所之一;国家首批“服务国家特殊需求专业硕士学位研究生教育试点高校”。2012年6月，顺利通过教育部本科教学合格评估。2013年1月，福建省人民政府批准为“省重点建设高校”。
截止到，集美、思明、厦软三个校区，其中思明校区为成人教育学院，厦软校区为软件工程学院，其他专业均在集美校区本部。占地1464亩，建筑面积50余万平方米，全日制在校生21000余人(含研究生，留学生)。学校基本形成亲产业的学科格局，涉及6个国家学科门类，共涵盖27个一级学科，2个硕士点，52个本科专业、68个本科专业方向。
福建江夏学院简介
福建江夏学院(FujianJiangxiaUniversity)是福建省人民政府举办的省属公办普通本科大学，于2010年3月正式成立。学校主校区坐落在福州地区大学城新校区，新老校区占地面积1648.14亩。世纪金源集团董事局主席黄如论先生捐资4.6亿元支持学校新校区建设。2010-，共投入6.35亿元(其中省政府拨款1.48亿元，黄如论先生二期捐款2.3亿元，旧校区置换款所得款中的2.57亿元)用于学校建设与发展的经费。
截止2013年6月，学校共有建筑总面积40.95万平方米，其中教学科研行政用房面积25.22万平方米，学生公寓及辅助用房20.53万平方米，有纸质藏书137.56万册，电子图书96万册。教学科研仪器设备总值5188.19万元(2012年12月数据)。设有13个二级学院和3个教学部。开设24个本科专业，涵盖经、管、法、工、理、艺等6个学科门类。面向全国11个省、自治区招生，有在校生15700多人，毕业生就业率97%以上。
旅菲闽籍华侨黄如论先生慷慨捐资2.3亿元，用于新校区教学楼、实验楼、行政办公楼、图书信息大楼等一期工程建设。捐建工程于2009年9月竣工。同时捐资2.3亿元用于江夏学院二期工程建设。
闽江学院
闽江学院位于福建省福州市，是2002年经教育部正式批准的公办全日制多科性本科大学、中国首批“服务国家特殊需求专业硕士学位研究生教育试点”高校之一和大陆最早实施“校校企”闽台高校联合培养本科人才项目的高校。
学校前身是创办于1958年的福州师范高等专科学校和创办于1984年的闽江职业大学，、中央任中共福州市委书记期间曾兼任闽江职业大学校长。学院施行“省市共建、以市为主”的办学体制，面向全国招生。
截至8月，学校校园总占地面积168.49公顷，校舍面积58.16万平方米，教学行政用房面积31.59万平方米，各类藏书279.8万册(含电子图书)。设有20个院(系)，全日制在校生2万余人，教师1100多人。
