福建省共有11所二本大学参与了福建二本大学排名，其中排名第一的是福建工程学院，排名第二的是厦门理工学院，排名第三的是闽南师范大学，排名前10的大学还有闽江学院、泉州师范学院、三明学院、福建江夏学院、莆田学院、武夷学院、宁德师范学院，以下是福建二本大学排名2016具体榜单：
| 福建二本大学排名 | 全国排名 | 学校名称 | 学校类型 |
| 1 | 377 | 福建工程学院 | 理工 |
| 2 | 412 | 厦门理工学院 | 理工 |
| 3 | 433 | 闽南师范大学 | 师范 |
| 4 | 466 | 闽江学院 | 理工 |
| 5 | 506 | 泉州师范学院 | 师范 |
| 6 | 560 | 三明学院 | 综合 |
| 7 | 580 | 福建江夏学院 | 综合 |
| 8 | 632 | 莆田学院 | 综合 |
| 9 | 632 | 武夷学院 | 师范 |
| 10 | 638 | 宁德师范学院 | 师范 |
| 11 | 643 | 龙岩学院 | 师范 |
